A história de Sítio Novo do Tocantins tem início por volta do ano de 1948, período em que as primeiras famílias chegaram à região em busca de terras férteis e melhores condições de vida. Entre os pioneiros que deram origem ao povoamento destacam-se Pedro Lima, Manoel Ferreira da Costa e Firmino Latarano, reconhecidos como os primeiros moradores da área onde hoje se encontra a sede do município.
O nome Sítio Novo surgiu a partir da percepção dos primeiros habitantes sobre a riqueza natural e a fertilidade do solo, que favoreciam o cultivo agrícola e a sobrevivência das famílias. Desde os primeiros tempos, a economia local baseou-se em atividades de subsistência, como a agricultura familiar, a extração de madeira, o aproveitamento do coco babaçu e a caça. Os extensos babaçuais tornaram-se um importante símbolo natural e cultural da região, influenciando o modo de vida e o trabalho da população.
Com a fixação das famílias, a comunidade passou a se organizar de forma mais estruturada. Foram construídas moradias permanentes e ampliadas as áreas de cultivo, com destaque para o plantio de arroz, feijão, milho e algodão, produtos essenciais para a alimentação e a economia local. Ao mesmo tempo, surgiram pequenos comércios, que contribuíram para o fortalecimento das relações sociais e para o desenvolvimento econômico da localidade.
O crescimento populacional e a organização social resultaram no reconhecimento administrativo da localidade. Em 9 de fevereiro de 1963, Sítio Novo foi elevado à categoria de Distrito, por meio da Lei nº 01/63, da Câmara Municipal de Itaguatins, então pertencente ao Estado de Goiás. Poucos meses depois, em 14 de outubro de 1963, a Lei Estadual nº 4.683/63 oficializou a emancipação política do distrito, elevando-o à categoria de município e atribuindo aos seus habitantes a denominação de sitionovenses.
Com a criação do Estado do Tocantins, em 1º de janeiro de 1989, o município teve sua identidade administrativa redefinida. Por meio do Decreto Legislativo nº 01/89, passou a denominar-se oficialmente Sítio Novo do Tocantins, fortalecendo seu vínculo histórico, político e cultural com o novo estado.
Atualmente, Sítio Novo do Tocantins está localizado no extremo norte do estado, no vale do rio Tocantins, integrando a tradicional região do Bico do Papagaio, a aproximadamente 720 quilômetros de Palmas. Sua história reflete a força do trabalho coletivo, a relação com a natureza e a construção de uma identidade cultural marcada pela resistência, pela agricultura familiar e pelas tradições do norte tocantinense.